生物安全柜是一种带有气流控制和空气过滤装置的操作柜，能有效降低生物实验中产生的病原微生物或有害气溶胶对操作人员和环境的危害。
在选择生物安全柜时，实验室应详细了解传染性微生物工作中生物安全级别的主要要素，并根据对个人、环境和社会提供的保护选择不同级别的生物安全柜。
生物安全等级1 (BSL-1):
适用于熟悉的病源，不会经常引起健康的成人病，对实验室人员和环境的潜在危险很小。实验室没有必要与建筑物内的一般步行区区分开来，一般按照标准分级生物操作在开放的实验台上工作。不需要特殊的抑制设备和设施(生物安全柜),一般不使用。
生物安全二级(BSL-2):
适用于对人和环境具有中度潜在危险的病原体。BSL-1与BSL-1的区别在于:①实验室人员接受过病原体处理的专门培训，并由合格的工作人员指导。②进行实验时限制进入实验室。③应特别注意被污染的锐器。④一些可能产生传染性气溶胶或飞溅物的过程应在生物安全柜或其他物料抑制设备中进行。可以选择一级和二级生物安全柜。
生物安全三级(BSL-3):
用于临床、诊断、教学、研究或生产设施，并在这一级开展有关内源性和外源性病原体的工作。如果病原体因暴露而被吸入，会引发严重的疾病，可能是致命的。实验人员应接受处理致病和潜在致命病原体的专业培训，并接受在病原体工作方面有经验的合格科学工作者的监督。与传染源操作相关的所有步骤都是在生物安全柜或其他物理抑制装置中进行的，所以最好选择二级或二级以上的生物安全柜。实验室需要特殊的设计和建造，室内压力为负压。
生物安全等级4 (BSL-4):
适用于对生命高度危险的危险病原体或外源性病原体。如果气溶胶能引起实验室感染或未知感染风险，并引起致命病原体，应选择三级生物安全柜和正压防护服。例如，SARS病毒对人或环境有中度的潜在危险，对携带病毒的病人的样本处理应在BSL-2或以上的实验室进行。为了给操作人员、环境和样品提供有效的保护，实验室应选用两级或两级以上或全排风的生物安全柜(B2型)。